Руководство по медицинской микробиологии. Общая и санитарная микробиология. Книга 1. Новинка

Описание

АННОТАЦИЯ:

"Руководство по медицинской микробиологии", написанное коллективом известных ученых и практических врачей, издается в трех книгах.

В книге 1 представлены материалы по общей и санитарной микробиологии, изложены основы теоретической и прикладной иммунологии. Описаны общие требования к организации и проведению работ с патогенными микроорганизмами, устройству и оснащению микробиологической клинической лаборатории, используемым методам дезинфекции и стерилизации. Приведены принципы таксономии и классификации микроорганизмов. Подробно изложены сведения о морфологии и ультраструктуре прокариотов, методах их микроскопического исследования, об основах энергетического обмена и процессах биосинтеза. Описаны методы их культивирования на питательных средах различного состава, тесты идентификации и дифференциации в классических и экспресс-вариантах. Включены материалы по использованию антимикробных препаратов, о методах определения антибиотикочувствительности, основах генетики бактерий и методах молекулярно-генетических исследований в диагностике инфекционных болезней, подробно изложена схема постановки ПЦР. Описаны строение и свойства бактериофагов, их использование в практике. Перечислены основные свойства патогенных бактерий и способы воспроизводства экспериментальной инфекции на моделях лабораторных животных. Несколько глав посвящено описанию основ иммунологии, определению параметров иммунного статуса организма человека, методов иммунодиагностики и вакцинопрофилактики инфекционных болезней. Подробно изложены основные задачи, методы санитарно-микробиологических исследований объектов внешней среды и оценка их показателей. Приведены рецептуры красок, индикаторов, буферных растворов и питательных сред для выделения, культивирования, идентификации бактерий и санитарно-микробиологических исследований.

Книга предназначена для микробиологов, врачей-лаборантов, преподавателей, учащихся в системе постдипломного образования, студентов ВУЗов.

ОТ АВТОРОВ:

Середина прошлого столетия ознаменовалась событием чрезвычайной важности: арсенал лекарственных средств мира пополнился совершенно новой группой антимикробных препаратов – антибиотиков для этиотропного лечения инфекционных заболеваний. Введение антибиотиков в повседневную медицинскую практику привело к снижению тяжести и летальности многих инфекционных болезней. Резко сократилось выявление глоточных стрептококковых инфекций: тонзиллита, фарингита, скарлатины. Снизилась заболеваемость стрептококковой пиодермией и рожистым воспалением. Стали исчезать такие тяжелые последствия глоточных стрептококковых заболеваний, как ревматизм и острый диффузный гломерулонефрит.

В двадцатом веке клиницисты и эпидемиологи получили ряд высокоэффективных лечебных и профилактических препаратов. Микробиологи и иммунологи предложили для профилактики дифтерии и раневых инфекций анатоксины, а также ряд высококачественных вакцин против брюшного тифа, коклюша, бруцеллеза, туляремии, чумы, холеры, сибирской язвы, менингококковой инфекции и др. В перечень признанных антиинфекционных средств вошли специфические иммуноглобулины. Неоценимый вклад внесли микробиологи, создав серию лечебных бактериофагов для больных кишечными, урологическими и гнойными инфекциями, не поддающимися терапевтическому воздействию антибиотиков. Для корректировки нарушений нормальных биоценозов полостей человека созданы бактерийные препараты – пробиотики.

На фоне этих достижений клиницисты и эпидемиологи обрели уверенность, что в обозримом будущем проблема бактериальных инфекционных болезней станет объектом истории медицины.

После введения в практику широкого ассортимента антибиотиков больные получили доступ к их применению без врачебных рекомендаций. Да и врачи не всегда назначали адекватную антибиотикотерапию, это послужило началом массовой бесконтрольной и нерациональной терапии, результатом которой явилось формирование клонов антибиотикорезистентных патогенных микроорганизмов.

Этот процесс пошел интенсивно по двум направлениям: за счет нарастания количества видов, утративших чувствительность к применяемому антибиотику, и за счет увеличения спектра устойчивости к двум и более препаратам. В результате такие инфекции, как туберкулез, гонорея, сепсис, пневмококковая пневмония, дизентерия и др. снова оказались в ряду непобежденных.

Примерно в этот же период – последняя треть XX века – стали вновь появляться некоторые инфекционные болезни, считавшиеся исчезнувшими или побежденными. Так, в результате многолетних нарушений принципов массовой иммунизации анатоксином в начале 90-х годов в России возник небывалый для развитой страны подъем заболеваемости дифтерией, преимущественно среди взрослых. Участились локальные вспышки тонзиллита, фарингита, скарлатины. Во многих странах стали возрождаться исчезнувшие еще в доантибиотическую эру случаи тяжелых инвазивных форм стрептококковой инфекции – некротический миозит, фасциит, синдром токсического шока с летальным исходом, что объясняют сменой циркулирующих штаммов под влиянием иммунологического прессинга и появлением более патогенных клонов. В последние две декады XX века в США и других странах зарегистрировано учащение случаев первичного ревматизма и рецидивов болезни. В довершение всего список инфекционных болезней XX века пополнился рядом новых, ранее неизвестных бактериальных инфекций.

Так, в 1976 году в Филадельфии среди участников Конгресса ветеранской организации «Американский легион» возникло 182 случая респираторной лихорадки и пневмонии неизвестной этиологии с 29 летальными исходами. Через несколько месяцев из легочной ткани умершего был выделен возбудитель «болезни легионеров», отнесенный к новому роду Legionella и семейству Legionellaceae. В 1983 году был открыт микроорганизм, связанный с возникновением гастрита, язвы и рака желудка, названный впоследствии Helicobacter pylori. Среди патогенных бактерий, открытие которых приходится на середину и даже на вторую половину ХХ века, относятся листерии, хламидии, возбудители ряда клещевых боррелиозов, кампилобактериозов, иерсиниозов, микоплазмозов, представители семейств риккетсий, анаплазм, коксиелл и др.

Успехи медицины, к сожалению, привели и к нежелательным последствиям – созданию когорт лиц с ослабленной резистентностью. Это недоношенные дети с малым весом, лица, леченные иммунодепрессантами, облучением, тяжелые хронические, онкологические больные, жизнь которых продлевается благодаря достижениям современной медицины. Выявленная недавно вирусная инфекция – вторичный иммунодефицит человека (ВИЧ-инфекция) также вносит свою долю в расширение числа лиц с ослабленной иммунологической защитой. Повсеместное распространение наркомании способствует увеличению количества людей со сниженной резистентностью.

Накопление такого рода «горючего материала» привело, в свою очередь, к развитию инфекций, вызываемых условно патогенными или даже считавшимися непатогенными бактериальными видами и штаммами из числа нормальной флоры человека и окружающей среды. Эти инфекции получили название «оппортунистических» (т. е. присоединившихся к основному заболеванию).

Проблема оппортунистических инфекций тесно смыкается с другой современной эпидемиологической проблемой – внутрибольничными инфекциями. Расширение многокоечной госпитальной сети и увеличение числа инвазивных вмешательств, с одной стороны, и формирование в стационарах антибиотикорезистентных клонов микроорганизмов – с другой, привело к распространению «местных» резистентных штаммов, вызывающих тяжелые инфекции у ослабленных пациентов. Установление этиологических агентов при оппортунистических и внутрибольничных инфекциях, порой фенотипически неотличимых от представителей нормальной микрофлоры, по понятным причинам представляет трудности для классических бактериологов.

Начиная с последней трети прошедшего века сильно расширились наши представления о патогенности микроорганизмов, накопилось множество методов ее выявления и установления ее степени (вирулентности). В конце ХХ века возникли и продолжают развиваться представления о роли бактерий при заболеваниях, считавшихся неинфекционными (например, роль хламидий в возникновении атеросклеротической болезни). Существенно пополнили наши знания исследования последних десятилетий о некультивируемых формах бактерий, не выявляемых классическими методами. Накопились факты, свидетельствующие о взаимоотношениях бактериальных клеток внутри их сообществ, способствующих выживанию, устойчивых к действию антимикробных препаратов и средств иммунной защиты. По-видимому, врач-бактериолог в недалеком будущем, изучая факторы патогенности клинического изолята, станет определять его способность к формированию биопленки – устойчивого сообщества бактериальной популяции. Несмотря на большие достижения ХХ века, открывшие новую эру в лечении и профилактике инфекционных болезней, проблема этого вида патологии не только не отошла на второй план, а, напротив, приобрела более высокую значимость, чем прежде, и поставила перед микробиологами ряд совершенно новых задач.

Основной задачей микробиологических лабораторий остается установление этиологического диагноза болезни. В современных условиях нередко при постановке физиологических тестов и определении биохимической активности микроорганизмов, в целях их идентификации, применяют стандартные тест-системы промышленного изготовления с использованием автоматических микробных анализаторов, упрощающих и ускоряющих проведение массовых бактериологических исследований.

Учитывая актуальность проблем современной инфектологии и растущий интерес специалистов к полноценному обследованию больных с подозрением на разного рода инфекционные процессы, а также необходимость грамотной интерпретации получаемых результатов, мы сочли целесообразным и своевременным подготовить настоящее «Руководство по медицинской микробиологии», состоящее из трех книг.

Книга I: Общая и санитарная микробиология.

Книга II: Частная медицинская микробиология и этиологическая
диагностика инфекций.

Книга III: Оппортунистические инфекции и методы их этиологической
диагностики.

Текст «Руководства» достаточно полно охватывает все аспекты общей и частной современной медицинской микробиологи. Изложенные в нем рекомендации базируются на современных научных сведениях и многолетнем личном опыте авторов, что, как мы надеемся, будет полезным в практической деятельности по выявлению, изучению и профилактике инфекционных болезней. Включены методы, рекомендуемые как обязательные, инструктивными материалами Министерства здравоохранения и социального развития России. Каждый раздел написан авторами, являющимися ведущими специалистами по рассматриваемому вопросу.

При написании «Руководства» мы стремились к тому, чтобы оно представляло интерес не только для микробиологов, но и для инфекционистов и эпидемиологов, расширяло бы кругозор каждого специалиста в области смежных дисциплин.


СОДЕРЖАНИЕ:

Список сокращений
От авторов

ЧАСТЬ I. ОБЩАЯ МЕДИЦИНСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ.

Глава 1 . Общие требования к организации работ с патогенными для человека микроорганизмами.
1.1. Классификация микроорганизмов по группам патогенности (опасности).
1.2. Регламентация работ с патогенными для человека микроорганизмами.
1.3. Лицензирование деятельности, связанной с использованием возбудителей инфекционных заболеваний.
1.4. Аккредитация микробиологических лабораторий.

Глава 2 . Оснащение микробиологической клинической лаборатории.
2.1. Требования к организации работ в медицинской микробиологической лаборатории.
2.2. Общелабораторное оборудование в микробиологической лаборатории.
2.3. Специальное оборудование для микробиологической лаборатории.

Глава 3 . Дезинфекция и стерилизация.
3.1. Организация и проведение дезинфекционных мероприятий в лабораториях.
3.2. Стерилизация.

Глава 4 . Принципы систематики, таксономии и классификации микроорганизмов.
4.1. Основные термины и понятия.
4.2. Прикладные аспекты систематики.
4.3. Связь таксономии с медицинской микробиологией.

Глава 5 . Морфология и ультраструктура прокариотических микроорганизмов.
5.1. Строение бактериальной клетки.

Глава 6 . Микроскопические методы исследования.
6.1. Микроскопы и методы микроскопии.
6.2. Методы изучения морфологии бактериальной клетки.

Глава 7 . Физиология прокариотических микроорганизмов.
7.1. Химический состав микроорганизмов.
7.2. Типы и механизмы питания микроорганизмов.
7.3. Ферменты микроорганизмов.
7.4. Метаболизм прокариотических микроорганизмов.
7.5. Рост и размножение микроорганизмов.
7.6. Влияние физико-химических факторов на рост микроорганизмов.
7.7. Способы адаптации бактерий к условиям существования.
7.8. Пигменты микроорганизмов и фотосинтез.
7.9. Светящиеся и ароматообразующие бактерии.

Глава 8 . Питательные среды в практике микробиологических исследований.
8.1. Назначение и классификация питательных сред.
8.2. Основные компоненты питательных сред. Необходимые условия роста микроорганизмов на питательных средах.
8.3. Приготовление питательных сред.
8.4. Контроль качества питательных сред.
8.5. Производители коммерческих питательных сред.

Глава 9 . Техника посева, культивирования и выделения чистых культур микроорганизмов.
9.1. Техника посева и выделения чистых культур микроорганизмов.
9.2. Методы изучения культуральных свойств микробов.
9.3. Бактериальный стандарт мутности.
9.4. Определение количества бактерий в 1 мл методом секторных посевов.

Глава 10 . Биологические и биохимические тесты идентификации микроорганизмов.
10.1. Окислительно-восстановительные ферменты бактерий.
10.2. Углеводы, состав, свойства, значение в медицинской микробиологии.
10.3. Окисление — брожение.
10.4. Декарбоксилирование аминокислот.
10.5. Дезаминирование аминокислот.
10.6. Протеолитические свойства бактерий.

Глава 11 . Антимикробные препараты. Определение чувствительности микроорганизмов к антибиотикам.
11.1. Краткая характеристика антибактериальных препаратов.
11.2. Методы оценки антибиотикочувствительности.

Глава 12 . Генетика бактерий.
12.1. Геном бактерий.
12.2. Формы переноса генетического материала бактерий.
12.3. Бактериальные плазмиды.
12.4. Мигрирующие элементы бактерий.
12.5. Перенос генов и изменчивость бактерий в природных условиях.

Глава 13 . Бактериофаги. Использование в диагностике, лечении и профилактике инфекционных болезней.
13.1. Выделение бактериофага из патологического материала и объектов внешней среды.
13.2. Электронная микроскопия в исследовании фагов.
13.3. Практическое применение бактериофагов.

Глава 14 . Факторы патогенности и токсигенности микроорганизмов.
14. 1. Общее представление о патогенности микроорганизмов.
14.2. Характеристика основных факторов патогенности бактерий.
14.3. Молекулярная организация бактериальных токсинов.
14.4. Другие факторы патогенности.

Глава 15 . Содержание и использование лабораторных животных в клинических микробиологических лабораториях.
15.1. Общие биологические сведения о грызунах, используемых в качестве лабораторных животных.
15.2. Санитарно-ветеринарные правила содержания лабораторных животных в экспериментально-биологической клинике (виварии).
15.3. Подготовка животных к опыту.
15.4. Способы заражения лабораторных животных.
15.5. Техника взятия крови у лабораторных животных.
15.6. Получение различных ингредиентов крови.
15.7. Умерщвление и вскрытие лабораторных животных.
15.8. Определение вирулентности микробов.

Глава 16 . Иммунитет. Иммунная система. Основные параметры иммунного статуса и методы его оценки.
16.1. Факторы неспецифической резистентности.
16.2. Антигены.
16.3. Иммунная система.
16.4. Виды иммунитета и формы иммунного ответа.
16.5. Основные параметры иммунного статуса человека и методы его оценки.
16.6. Методы определения основных параметров иммунного статуса макроорганизма и серодиагностика инфекционных болезней.

Глава 17 . Препараты для диагностики бактериальных инфекций и идентификации возбудителей.

Глава 18 . Вакцинопрофилактика бактериальных инфекций.
18.1. История развития иммунопрофилактики.
18.2. Общая характеристика профилактических вакцин.
18.3. Бактериальные вакцины, входящие в календарь обязательных профилактических прививок.
18.4. Бактериальные вакцины, не входящие в календарь обязательных профилактических прививок.

Глава 19 . Полимеразная цепная реакция в диагностике инфекционных болезней.
19.1. Сущность полимеразной цепной реакции.
19.2. Техника постановки ПЦР.
19.3. Преимущества ПЦР.
19.4. Трудности ПЦР.
19.5. Практические рекомендации по применению ПЦР в медицинских исследованиях.
19.6. ПЦР в реальном времени — самый современный метод молекулярной диагностики.

Глава 20 . Иммунодиагностика инфекционных заболеваний с использованием иммуноферментного анализа.
20.1. Непрямой твердофазный ИФА.
20.2. Другие виды ИФА.
20.3. Конкурентный ИФА (Количественное определение циркулирующих антител и антигенов; тест-системы на основе конкурентного ИФА).
20.4. ELISPOT — Иммуноферментный тест с локальным связыванием для качественного выявления выработки антител и интерлейкинов на клеточном уровне в системе in vitro.
20.5. Основные требования к иммунодиагностике инфекционных заболеваний методом ИФА.

Глава 21 . Современные технологии в клинической микробиологии.
21.1. Идентификация микроорганизмов с использованием коммерческих микротест-систем.
21.2. Автоматизация и компьютеризация при проведении микробиологических исследований.
21.3. Система регистрации и анализа в работе микробиологических лабораторий.

Глава 22 . Экспресс-методы идентификации микроорганизмов.
22. 1. API-идентификация.
22.2. Slidex-идентификация и диагностика.
Рецептура красителей, индикаторов, буферных растворов, реактивов и питательных сред для постановки биохимических тестов.

ЧАСТЬ II. САНИТАРНАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ.

Глава 1 . Краткий очерк развития санитарной микробиологии.

Глава 2 . Санитарно-микробиологическое исследование воды.
2.1. Общие требования к качеству воды.
2.2. Методы исследования.

Глава 3 . Санитарно-микробиологическое исследование почвы.
3.1. Общая характеристика микрофлоры почвы и цели санитарно-микробиологического исследования почвы.
3.2. Методы исследования.

Глава 4 . Санитарно-микробиологическое исследование воздуха.
4.1. Общие сведения о микрофлоре воздуха и направлениях ее исследования.
4.2. Методы исследования.

Глава 5 . Санитарно-микробиологическое исследование пищевых продуктов.
5.1. Особенности микрофлоры пищевых продуктов.
5.2. Методы исследования.

Глава 6 . Санитарно-микробиологическое исследование фармацевтических препаратов.
6.1. Основные принципы микробиологического контроля качества лекарственных средств.
6.2. Методы исследования фармацевтических препаратов на стерильность.
6.3. Методы исследования микробиологической чистоты фармацевтических препаратов.

Питательные среды, используемые для санитарно-микробиологических исследований.
1. Дифференциально диагностические среды для некоторых грамотрицательных бактерий.
2. Среды для учета различных групп почвенных микроорганизмов.
3. Среды для Pseudomonas aeruginosa.
4. Среды для стрептококков.
5. Среды для мезофильных, термофильных аэробных и факультативно-анаэробных микроорганизмов.
6. Среды для дрожжей и плесневых грибов.
7. Среды для бактерий группы кишечных палочек.
8. Среды для сальмонелл.
9. Среды для стафилококков.
10. Среды для анаэробов.
11. Среды для энтерококков.
12. Среды для Proteus.
13. Среды для Bacillus cereus.
14. Среды для молочно-кислых бактерий.
15. Среды для листерий.
16. Среды для галофильных вибрионов.
17. Питательные среды для бактериологического исследования фармацевтических препаратов.
Перечень использованных нормативных документов на методы испытаний и исследований, действующих на декабрь 2006 года.

Предметный указатель.
Словарь терминов.